Charles Alphonse Deperne est un architecte français né le 29 avril 1836 à Lille. Il est le fils de Paul Deperne (1804-1883) et le frère de Jules Deperne (1838-1890), également architectes.
Élève d'Hippolyte Le Bas et Léon Ginain, il est formé à l'École des beaux-arts de Paris à partir de 1856.